La parroquia Santa Mónica fue erigida por decreto del Cardenal Juan Landázuri Ricketts, Arzobispo de Lima, el 25 de marzo de 1965, bajo la advocación de Santa Mónica, madre de San Agustín y ejemplo de fe perseverante. Ese mismo año fueron nombrados como primer párroco Fr. Gaspar Vega Martínez, OSA, y como vicario cooperador Fr. Lucio Fernández Solís, OSA, dando inicio a la vida pastoral de esta comunidad.
En 1967 asumió como párroco Fr. Miguel Díez Medina, OSA, quien impulsó el crecimiento de la parroquia y el desarrollo del futuro complejo parroquial. En 1970 se concretó la adquisición del terreno, ubicado en la urbanización Limatambo, San Isidro, gracias a una modalidad de venta-donación por parte de Inversiones Brescia S.A. La construcción del templo comenzó en 1971.
Un momento significativo en la historia de la parroquia fue su consagración solemne, realizada el 15 de diciembre de 1974 por el Cardenal Juan Landázuri Ricketts. La ceremonia se llevó a cabo con un rito litúrgico tradicional, en el que el cardenal tocó las puertas del templo con un báculo mientras proclamaba: “Alzad, oh puertas, vuestros dinteles; levántense portales para que entre el Rey de la Gloria”, marcando así la apertura oficial del templo a la vida de la comunidad.
En el año 2008, la administración pastoral de la parroquia fue cedida al Arzobispado de Lima, iniciando una nueva etapa junto a la Arquidiócesis.
En 2026, la gestión de la parroquia vuelve a la Provincia Agustina del Perú, renovando el compromiso de seguir acompañando a esta comunidad desde la fe y la misión evangelizadora.
